Világ

A tudós törölt koronavírus-adatokat tár fel Kínából

Tizenhárom genetikai szekvenciát – amelyeket a COVID-19 fertőzésben szenvedő emberektől izoláltak a kínai járvány kezdeti napjaiban – tavaly titokzatosan töröltek egy online adatbázisból, de mostanra helyreállították őket.

Jesse Bloom, a Fred Hutchinson Rákkutató Központ számítástechnikai biológusa és a vírusfejlődés szakembere megállapította, hogy a szekvenciákat egy online adatbázisból távolították el a kínai Wuhan-i tudósok kérésére. De némi internetes zuhanással sikerült helyreállítania a Google Cloud szolgáltatásban tárolt adatok másolatait.

A szekvenciák alapvetően nem változtatják meg a tudósok megértését a a COVID-19 eredete – beleértve azt a kérdést, hogy a koronavírus természetes módon terjed-e állatokról emberekre, vagy megszökött-e laboratóriumi balesetben. De törlésük növeli az aggodalmakat, miszerint a kínai kormány titkolózása akadályozta a nemzetközi erőfeszítéseket a COVID-19 kialakulásának megértése érdekében.

Bloom eredményeit a előnyomtatott papír, amelyet más tudósok még nem értékeltek, kedden közzétették. “Azt hiszem, ez minden bizonnyal összhangban van a kísérletek elrejtésére irányuló kísérlettel” – mondta a BuzzFeed News-nak.

Bloom utána értesült a törölt adatokról dolgozat elolvasása Carlos Farkas által vezetett csoporttól a kanadai Manitoba Egyetemen a SARS-CoV-2 legkorábbi genetikai szekvenciáiról. Farkas cikke a kórházi járóbetegektől vett mintákat írta le egy wuhani kutató projektje során, akik diagnosztikai teszteket fejlesztettek ki a vírusra. De amikor Bloom megpróbálta letölteni a sorozatokat a Sequence Read Archive, az U National Institute of Health által működtetett online adatbázis, hibaüzeneteket kapott, amelyek azt mutatják, hogy eltávolították őket.

Bloom rájött, hogy az SRA-adatok másolatait a Google által üzemeltetett szervereken is fenntartják, és képes volt kitalálni azokat az URL-eket, ahol a hiányzó szekvenciák megtalálhatók a felhőben. Ilyen módon kinyert 13 genetikai szekvenciát, amelyek segíthetnek megválaszolni a koronavírus alakulásának és eredetének kérdéseit.

Bloom megállapította, hogy a törölt szekvenciák, hasonlóan a későbbiekben a városon kívül gyűjtött más szekvenciákhoz, jobban hasonlítanak a denevér koronavírusaira – amelyekről feltételezik, hogy a COVID-19 okozó vírus végső ősei -, mint a wuhani Huanan Seafood Markethez kapcsolódó szekvenciák. Ez hozzáteszi a korábbi javaslatokat, miszerint a tenger gyümölcsei piac lehet a COVID-19 korai áldozata, nem pedig az a hely, ahol a koronavírus először átugrott az állatokból az emberekbe.

“Ez egy nagyon érdekes tanulmány, amelyet Dr. Bloom végzett, és véleményem szerint az elemzés teljesen helyes” – mondta Farkas e-mailben a BuzzFeed News-nak. Scott Gottlieb, korábban az Élelmiszer- és Gyógyszerügyi Hivatal vezetője, a Twitteren is méltatta az eredményeket.

De néhány tudós kevésbé volt lenyűgözve. “Ez valóban nem járul hozzá az eredetvitához” – mondta Robert Garry, a New Orleans-i Tulane Egyetem e-mailben a BuzzFeed Newsnak. Garry azzal érvelt, hogy a huanani piac vagy más wuhani piac továbbra is a COVID-19 forrása lehet.

Bloom egyike azon 18 tudósnak, akik májusban levelet tett közzé bírálva a WHO és Kína tanulmányát a SARS-CoV-2 eredetéről. A tudósok azzal érveltek, hogy a WHO – Kína jelentés nem adott kiegyensúlyozott megfontolást azoknak a versengő elképzeléseknek, amelyek szerint a koronavírus természetes módon terjedt állatokról emberekre, vagy megszökött egy laboratóriumból – ez az elmélet a jelentés szerint „rendkívül valószínűtlen”. A WHO – Kína jelentés közzététele után az USA és további 13 kormány panaszkodott hogy „hiányzott a hozzáférés a teljes, eredeti adatokhoz és mintákhoz”.

A törölt vírusszekvenciákat először 2020 március elején töltötték fel az SRA-ba, körülbelül akkor, amikor a Wuhani Egyetem Yan Li és Tiangang Liu által vezetett kutatói kiadott egy nyomdát munkájuk leírása genetikai szekvenálással a COVID-19 diagnosztizálásához. Néhány nappal azelőtt Kína Állami Tanácsa parancsolta hogy a COVID-19-hez kapcsolódó összes dokumentumot központilag jóvá kell hagyni.

A szekvenciákat ezután júniusban kivonták az SRA-ból, annak idején a lap végleges változata tudományos folyóiratban jelent meg. Az NIH szerint a szerzők a szekvenciák eltávolítását kérték. “A kérelmező jelezte, hogy a szekvencia információk frissültek, egy másik adatbázisba kerültek, és azt kívánta, hogy az adatok eltávolításra kerüljenek az SRA-ból, hogy elkerüljék a verziókezelési problémákat” – mondta Amanda Fine, az NIH szóvivője a BuzzFeed Newsnak e-mailben.

Nem világos azonban, hogy a szekvenciákat azóta online feltöltötték-e egy másik adatbázisba.

“Nincs valószínű tudományos oka a törlésnek” – írta Bloom előnyomatában, azzal érvelve, hogy a szekvenciákat valószínűleg “törölték, hogy elhomályosítsák létezésüket”. Ez azt sugallta, írta, hogy „a szívből fakadó erőfeszítések a járvány korai terjedésének nyomon követésére”.

Bár a szekvenciákat törölték, Garry rámutatott, hogy a bennük rejlő legfontosabb genetikai mutációkat még mindig a wuhani csapat záró dolgozatának táblázatában tették közzé. “Jesse Bloom nem talált semmi újat, ami még nem része a tudományos szakirodalomnak” – mondta Garry a BuzzFeed Newsnak, azzal vádolva Bloomot, hogy előnyomtatását “tudománytalan és felesleges módon írta”.

Bloom azt írta a wuhani kutatóknak, hogy miért szüntették meg a szekvenciákat, de nem kaptak választ. Li és Liu hasonlóan nem válaszolt azonnal a BuzzFeed News kérdésére.

Nem ez az első eset, hogy a tudósok aggályokat vetnek fel az adatok eltávolításával kapcsolatban, amelyek segíthetnek megválaszolni a COVID-19 eredetével kapcsolatos kérdéseket. A Wuhan Virológiai Intézet által fenntartott koronavírus-szekvenciákkal kapcsolatos információkat tartalmazó fő adatbázis – amely a vírus esetleges „laboratóriumi szivárgásával” kapcsolatos spekulációk középpontjában áll – offline állapotba került 2019 szeptemberében. Amikor a WHO – Kína tagjai ezt összeállítják tanulmányozta az eredetét a járvány februárjában meglátogatta az intézetet, közölték velük az adatbázist, amely állítólag adatokat tartalmazott 22 000 koronavírus mintán és szekvencia nyilvántartáson, ismételt feltörési kísérletek után eltávolítottuk.